实践

一个免费的云平台安全的神经科学数据分析

好的研究方法和实践科学心理学发展至关重要。这个部门提供教程和易于使用的清单展示新的以及可靠的研究实践,方法论的方法和统计的解决方案。

Brainlife。io是一个免费的和易于使用的平台,使研究人员分析和复杂的神经科学数据重用。半岛体育官方网址入口平台开发了近3年前Pestilli实验室,然后印第安纳大学。出现从一个网络中心的想法,研究人员可以使用现代技术合作,以减少人为错误数据管理,如不匹配的文件或意半岛体育官方网址入口外的变化统计程序,以及分析数据和重用之前分析发表在一个有效的方法,根据佛朗哥Pestilli,现在在德州大学奥斯丁分校。

Brainlife。io:

项目

管理数据、处理和结果。与合作者分享项目私下或公开Brainlife。io社区。

应用程序

使用已开发应用程序来管理和分析神经科学数据。

批量处理

独特analyses-management机制使简单的提交和监测成千上万的流程,允许大数据和高可伸缩性。

数据可视化

提供了一组不同类型的数据的可视化工具。开发人员可以启动工具使用上的任何数据集托管平台。

数据来源

确保可再生的科学成果通过追踪每个数据集的历史,包括输入和输出数据文件、应用程序版本和配置参数,计算机资源用于生成数据集。

出版物

自动创建单个记录保存程序和数据引用的一个独特的DOI。这些出版物是长期保存的存档的安全。

在brainlife.io得多。

约有1500用户和计数,Brainlife。io是整个世界,Pestilli说。虽然这个平台不可能帮助研究人员理解复杂的分析,它可以帮助他们犯更少的错误时进行分析半岛体育官方网址入口。“我只能成为一个好科学家更好的帮助他们花更多的时间在他们的科学而不是管理软件分析,”他说。

共享和重用

Pestilli是越来越多的研究人员争取更多的结构在如何分享资产。半岛体育官方网址入口Brainlife。io可以安全地共享分析代码,神经影像数据和计算资源,从而导致神经科学的研究结果的再现性。

此外,该平台有助于新发现在以往收集的数据。升级改造的“我们创建这个概念数据通过连接与代码的数据用于分析成一个统一的构造,可以在网上呆在一起,”Pestilli说。

其他Brainlife。io功能:

  • 400多名分析流,可以互相结合
  • 工具有关neuroimaging-functional神经成像的三种主要形式,结构神经影像学和弥散加权成像
  • 一套可视化工具连接体(即。、网络)、功能地图,和激活
  • 访问国家超级计算机、私有云、高性能计算机系统和机构和发送数据的能力,并将其分解成不同的计算机世界各地

“它不只是在你的电脑上运行。在网络上,这是一个中心,并且可以管理和协调计算在不同的机器上和不同的中心,”Pestilli解释道。此外,由于该平台可以在私人或公共电脑计算,研究人员也可以分享自己的计算资源。半岛体育官方网址入口

平台的另一个特点是使用集装箱化,技术一起包应用程序所有的相关文件,并允许他们在不同的电脑运行在一种有效的方式。集装箱化创造了“一个小版本的电脑,让它变成一个软件映像,这样你就可以把电脑,“Pestilli解释道。在实践中,这使研究人员更容易运行其他研究者的分析而不必安装任何电脑。半岛体育官方网址入口“你可以用这个小版本的我的电脑,”他说。“如果我做了工作,你可以让它工作。”

未来是在云中

Brainlife的目标之一。io是——他们的电脑实验室和移动到一个公共空间,思想、数据、分析、错误和突破可以公开共享。Pestilli描述云计算和新技术的作用可能在未来的科学研究。“半岛体育官方网址入口研究人员仍有点害怕公开获取数据,”他说。”但是我认为恐惧是裂纹因为再现性和透明度的必要性在心理科学,神经科学,和其他学科。像Brainlife”项目。io,他说,“真的可以提供一个窗口可以打开的机会接受这些新技术。”

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